Végzettség

• Certified Cytometrist (2011); International Cytometry Certification Examination
• PhD fokozat (2009); Pécsi Tudományegyetem, ÁOK, Pathologiai Intézet
• MSc diploma – Kémia (2006); Pécsi Tudományegyetem, TTK
• MSc diploma – Biológia (2003); Pécsi Tudományegyetem, TTK

Munkahelyek

• 2020-: Semmelweis Egyetem, I. sz. Patológiai és Kísérleti Rákkutató Intézet (tudományos főmunkatárs)
• 2015-2020: Semmelweis Egyetem, I. sz. Patológiai és Kísérleti Rákkutató Intézet (tudományos munkatárs)
• 2015-2020: Center for Molecular Medicine of the Austrian Academy of Sciences, Vienna, Austria (Senior NGS scientist)
• 2014-2015: Institute of Cancer Research, Translational Oncogenomics, London, UK (Posztdoktor kutató)
• 2012-2014: Institute of Cancer Research, Childhood Leukaemia Biology, London, UK (Marie Curie ösztöndíjas)
• 2008-2012: Pécsi Tudományegyetem, ÁOK, Pathologiai Intézet (Tumorcitogenetikai laborvezető; tudományos munkatárs 2009-)
• 2006-2007: Pécsi Tudományegyetem, ÁOK, Pathologiai Intézet (tudományos segédmunkatárs)

Kutatási terület

• Molekuláris onkohematológia
• Onkogenomika, epigenomika, transzkriptomika
• Evolúciós rákkutatás

Társasági tagságok

• Young Academy of Europe, 2021-
• Fiatal Kutatók Akadémiája, 2019-2024. (Vezetőségi tag 2019-2021)
• International Society for Advancement of Cytometry
• European Hematology Association
• European Cytogeneticists Association
• Magyar Személyreszabott Medicina Társaság
• Magyar Humángenetikai Társaság

Oktatás

Semmelweis Egyetem (2015-)

• Molekuláris onkológia II., posztgraduális képzés (kurzusvezető)
• Molekuláris onkológia I., posztgraduális képzés

Pécsi Tudományegyetem (2004-2012)

• Molekuláris genetika és genomika, graduális képzés
• Molekuláris patológia, graduális képzés
• Citogenetikai aberrációk hemopoetikus tumorokban, posztgraduális képzés (kurzusvezető)
• In situ hibridizáció – interfázis citogenetika és alkalmazásai a patológiában, posztgraduális képzés

PhD hallgatók

• Péterffy Borbála (2021-2025)
• Bedics Gábor (2019-2023, 50%)
• Krizsán Szilvia (2018-2022, 50%)
• Kiss Richárd (2016-2020, 50%; védés: 2020/12, 100%)
• Kosztolányi Szabolcs (2016-2020; védés: 2020/09, 100%)

Díjak, ösztöndíjak, pályázatok

• NKFIH FK_20 Kutatási pályázat (ID: FK134253) 2020-2024. (vezető kutató)
• Bolyai+ ösztöndíj. (ID: ÚNKP-20-5-SE-22) 2020-2021.
• Bolyai+ ösztöndíj. (ID: ÚNKP-19-4-SE-77) 2019-2020.
• STIA_18_KF pályázat. (ID: 26955/AOPTKT/2019) 2018-2019. (vezető kutató)
• Bolyai+ ösztöndíj. (ID: ÚNKP-18-4-SE-62) 2018-2019.
• Bolyai János Kutatási Ösztöndíj. (ID: BO/00320/18/5) 2018-2021.
• Új metodikai és interdiszciplináris PhD kurzusok szervezése pályázat. 2018-2021. (kurzusvezető)
• Új Nemzeti Kiválósági Program ösztöndíj. (ID: ÚNKP-17-4-III-SE-9) 2017-2018.
• Legjobb összefoglaló közlemény díj, 2016. (Magyar Onkológusok Társasága)
• NKFIH K_16 Kutatási pályázat (ID: K119950) 2016-2020. (vezető kutató)
• Kiváló bíráló, 2015. (Leukemia Research folyóirat)
• Biomedical Research Centre grant. 2014-2015. (NIHR, London, UK; társkutató)
• Falling Walls Lab Finale 2014 and A.T. Kearney Scholar at the Falling Walls Conference, Berlin, Germany, 2014.
• 64^thLindau Nobel Laureate Meeting, Lindau, Germany, 2014.
• Legjobb poszter díj, 44^th Congress of the International Society of Paediatric Oncology, London, UK, 2012. (SIOP)
• Marie Curie Intra-European Fellowship. (ID: 299946) Institute of Cancer Research – Royal Cancer Hospital, London, UK.  2012-2014. (Best proposal in ‘Life Science’).
• Fulbright Kutatói ösztöndíj. Fred Hutchinson Cancer Research Center, Seattle, WA, USA. 2012/2013. (visszautasítva)
• Marylou Ingram Scholar 2011-2015. (International Society for Advancement of Cytometry)
• Baross Gábor Program K+F pályázat. 2010-2012. (ID: REG-DD-09-2-2009-0100; társkutató)
• Erasmus Student Study Mobility Scholarship, Wolverhampton, UK, 2004. (visszautasítva)
• TDK I. helyezés, Pécs, 2003.
• Konferencia részvételi támogatások Európába (#10) és az USA-ba (#4). (EMBO, EHA, EAHP, ECA, ISAC)

Válogatott közlemények

• Alpar D, Egyed B, Bodor C, Kovacs GT. Single-cell sequencing: Biological insight and potential clinical implications in pediatric leukemia. Cancers. 2021 Nov 12;13(22):5658.
• Bodor C, Kotmayer L, Laszlo T, Takacs F, Barna G, Kiss R, Sebestyen E, Nagy T, Hegyi LL, Mikala G, Fekete S, Farkas P, Balogh A, Masszi T, Demeter J, Weisinger J, Alizadeh H, Kajtar B, Kohl Z, Szasz R, Gergely L, Gurbity Palfi T, Sulak A, Kollar B, Egyed M, Plander M, Rejto L, Szerafin L, Ilonczai P, Tamaska P, Pettendi P, Levai D, Schneider T, Sebestyen A, Csermely P, Matolcsy A, Matrai Z, Alpar D. Screening and monitoring of BTK^C481S mutation in a real-world cohort of patients with relapsed/refractory chronic lymphocytic leukemia during ibrutinib therapy. Br J Haematol. 2021 Jul;194(2):355-364.
• Kiss R, Gango A, Benard-Slagter A, Egyed B, Haltrich I, Hegyi L, de Groot K, Kiraly PA, Krizsan S, Kajtar B, Piko H, Pajor L, Vojcek A, Matolcsy A, Kovacs G, Szuhai K, Savola S, Bodor C, Alpar D. Comprehensive profiling of disease-relevant copy number aberrations for advanced clinical diagnostics of pediatric acute lymphoblastic leukemia. Mod Pathol. 2020 May;33(5):812-824.
• Rendeiro AF, Krausgruber T, Fortelny N, Zhao F, Penz T, Farlik M, Schuster LC, Nemc A, Tasnady S, Reti M, Matrai Z, Alpar D*, Bodor C*, Schmidl C*, Bock C*. Chromatin mapping and single-cell immune profiling define the temporal dynamics of ibrutinib response in CLL. Nat Commun. 2020 Jan 29;11(1):577.
• Barthel et al. Longitudinal molecular trajectories of diffuse glioma in adults. Nature. 2019 Dec;576(7785):112-120.
• Gango A*, Alpar D*, Galik B*, Marosvari D, Kiss R, Fesus V, Aczel D, Eyupoglu E, Nagy N, Nagy A, Krizsan S, Reiniger L, Farkas P, Kozma A, Adam E, Tasnady S, Reti M, Matolcsy A, Gyenesei A, Matrai Z, Bodor C. Dissection of subclonal evolution by temporal mutation profiling in chronic lymphocytic leukemia patients treated with ibrutinib. Int J Cancer. 2020 Jan 1;146(1):85-93.
• Kiss R, Alpar D, Gango A, Nagy N, Eyupoglu E, Aczel D, Matolcsy A, Csomor J, Matrai Z, Bodor C. Spatial clonal evolution leading to ibrutinib resistance and disease progression in chronic lymphocytic leukemia. Haematologica. 2019 Jan;104(1):e38-e41.
• Klughammer et al. The DNA methylation landscape of glioblastoma disease progression shows extensive heterogeneity in time and space. Nat Med. 2018 Oct;24(10):1611-1624.
• Kosztolanyi S, Kiss R, Atanesyan L, Gango A, de Groot K, Steenkamer M, Jakso P, Matolcsy A,Kajtar B, Pajor L, Szuhai K, Savola S, Bodor C, Alpar D. High-throughput copy number profiling by digital multiplex ligation-dependent probe amplification in multiple myeloma. J Mol Diagn. 2018 Nov;20(6):777-788.
• Datlinger P, Rendeiro A, Schmidl C, Krausgruber T, Traxler P, Klughammer J, Schuster L, Kuchler A, Alpar D, Bock C. Pooled CRISPR screening with single-cell transcriptome readout. Nat Methods 2017 Mar;14(3):297-301.
• Alpar D, Barber L, Gerlinger M. Genetic intratumor heterogeneity. In: Gray S (ed). Epigenetic Cancer Therapy. San Diego:Academic Press,  pp. 571-594. (ISBN:9780128002063)
• Alpar D, Wren D, Ermini L, Mansur MB, van Delft FW, Bateman CM, Titley I, Kearney L, Szczepanski T, Gonzalez de Castro D, Ford AM, Potter NE, Greaves M. Clonal origins of ETV6/RUNX1⁺ acute lymphoblastic leukemia: studies in monozygotic twins. Leukemia 2015 Apr;29(4):839-846.
• Bateman CM*, Alpar D*, Ford AM, Colman SM, Wren D, Morgan M, Kearney L, Greaves MF. Evolutionary trajectories of hyperdiploid ALL in monozygotic twins. Leukemia 2015 Jan;29(1):58-65.
• Alpar D, de Jong D, Holczer-Nagy Z, Kajtar B, Savola S, Jakso P, David M, Kosztolanyi S, Kereskai L, Pajor L, Szuhai K. Multiplex ligation-dependent probe amplification and fluorescence in situ hybridization are complementary techniques to detect cytogenetic abnormalities in multiple myeloma. Genes Chromosomes Cancer. 2013 Sep;52(9):785-93.
• Pajor G, Kajtar B, Pajor L, Alpar D. State-of-the-art FISHing: automated analysis of cytogenetic aberrations in interphase nuclei. Cytometry A. 2012 Aug;81(8):649-63.
• Nagy Z, Kajtar B, Jakso P, David M, Kosztolanyi S, Hermesz J, Kereskai L, Pajor L, Alpar D. Evolutionary sequence of cytogenetic aberrations during the oncogenesis of plasma cell disorders. Direct evidence at single cell level. Leuk Res. 2011 Aug;35(8):1114-6.

További aktivitások

• EU pályázatok bírálata, 2018-
• Szerkesztőbizottsági tagság: Leukemia Research folyóirat, 2017-
• Programbizottsági tagság: CYTO kongresszusok (International Society for Advancement of Cytometry) 2011-
• Kézirat bírálat:  Publons

Egyéb képzettség

• GLP and GCP training, Royal Marsden Hospital, London, UK, 2014.
• Single-Cell Gene Expression Analysis, EMBO Practical Course, EMBL Heidelberg, 2013.
• EBI Next Generation Sequencing Workshop, Wellcome Trust, Cambridge, UK, 2013.
• MLPA mix development and testing, MRC-Holland, Amsterdam, The Netherlands, 2013.
• CML / MPN Global Opinion Leader Summit, Munich, Germany, 2012.
• International BioCamp 2011. Novartis Biotechnology Leadership Camp, Basel, Switzerland, 2011.
• Training in SNP-array, COBRA-FISH and MLPA technologies, LUMC, The Netherlands, 2011.
• European Advanced Postgraduate Course in Molecular Cytogenetics, Nimes, France, 2011.